Історія зі всесвіту NieR: Automata! 11941 рік н. е. Аби відвоювати Землю в машинних форм життя, четверо членкинь загону YoRHa здійснили висадку в Перл-Гарбор. За підтримки сил спротиву, відправлених на планету двісті років тому, вони рушають до ліфтової зали головного ворожого сервера, яка розташована на вершині гори Ка’ала. Тим часом у Бункері Футаба та Йоцуба загнані в глухий кут Радою людства й командувачкою, які блокують усі запити на підтримку загону YoRHa, що опинився у вкрай скрутному становищі… Але що може бути важливішим за успішне виконання операції?